目录号:PE103
试剂盒组成、储存、稳定性:
试剂盒组成
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保存
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50次(PE103-01)
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平衡液BS
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室温
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5ml
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RNaseA(10mg/ml)
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-20℃
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150µl
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溶液A
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4℃
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15 ml
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溶液B
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室温
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15 ml
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溶液D
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室温
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15 ml
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内毒素清除剂ER
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-20℃
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5ml
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漂洗液WB
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室温
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15 ml
第一次使用前按说明加指定量乙醇
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洗脱缓冲液EB
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室温
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15ml
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吸附柱AD
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室温
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50个
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收集管CT(2ml)
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室温
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50个
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本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。
内毒素清除剂ER常温运输,4度可以保存一个月,长期保存放-20℃。
储存事项:
1、第一次使用时,将试剂盒所带的全部RNase A加入溶液A后(终浓度100ug/ml)置于2-8℃保存。如果溶液A中RNase A失活,提取的质粒可能会有微量RNA残留,在溶液A中补加RNase A即可。
2、环境温度低时溶液B中SDS可能会析出浑浊或者沉淀,可在37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清,不要剧烈摇晃,以免形成过量的泡沫。
3、避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
产品介绍:
本试剂盒采用改进SDS-碱裂解法裂解细胞,通过独特的内毒素清除剂ER选择性结合离心除去内毒素,然后离心吸附柱内的硅基质膜在高盐、低pH值状态下选择性地结合溶液中的质粒DNA,再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除,最后低盐、高pH值的洗脱缓冲液将纯净质粒DNA从硅基质膜上洗脱。
产品特点:
1、离心吸附柱内硅基质膜全部采用世界著名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。
2、独特工艺配方清除内毒素,内毒素含量极低(<0.1 EU/μg DNA),细胞转染效果极佳。也可直接用于酶切、转化、PCR、体外转录、测序、等各种分子生物学实验。
注意事项
1、所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机。
2、提取质粒的量与细菌培养浓度、质粒拷贝数等因素有关。一般高拷贝质粒,建议接种单菌落于1.5-4.5 ml加合适抗生素的LB培养基, 过夜培养14-16个小时,可提取出多达20µg的纯净质粒。如果所提质粒为低拷贝质粒或大于10kb的大质粒,应适当加大菌体使用量,使用5-10 ml过夜培养物,同时按比例增加A、B、D的用量,其它步骤相同。
3、得到的质粒DNA可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。OD260值为1相当于大约50μg/ml DNA。电泳可能为单一条带,也可能为2条或者多条DNA条带,这主要是不同程度的超螺旋构象质粒泳动位置不一造成,与提取物培养时间长短、提取时操作剧烈程度等有关。本公司产品正常操作情况下基本超螺旋可以超过90%。
4、质粒DNA确切分子大小, 必须酶切线性化后,对比DNA分子量Marker才可以知道。处于环状或者超螺旋状态的的质粒,泳动位置不确定,无法通过电泳知道其确切大小。
5、洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确保pH大于7.5,pH过低影响洗脱效率。用水洗脱质粒应该保存在-20℃。质粒DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。
关于平衡液BS的使用
介绍:核酸吸附硅胶膜柱子长期放置过程中会同空气中的电荷/尘埃发生反应而影响其核酸的结合能力。硅胶柱经平衡液BS预处理后可大大减少柱子中硅胶膜的憎水基团,提高核酸的结合能力。从而提高硅胶柱子回收效率或者产量。平衡液BS是强碱性溶液,若不小心碰到,请用大量自来水清洗。用完后需盖紧瓶盖,以免接触空气。室温保存。在保存过程中可能有沉淀生成,请加热至37℃使沉淀完全消失。
使用方法:取一个新的硅胶膜吸附柱装在收集管CT中,吸取100μl的平衡液BS至柱子中。13000 rpm离心1分钟,倒掉收集管CT中废液,将吸附柱子重新放回收集管CT。此时平衡液BS预处理柱子完毕。接后续的操作步骤。
操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)
提示:
● 第一次使用前请先在漂洗液WB瓶中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
● 将RNase A全部加入溶液A中,混匀,每次使用后置于2-8℃保存。
1、取1.5-4.5 ml过夜培养的菌液,12,000rpm离心30秒,尽可能的倒干上清,收集菌体。
收集超过1.5 ml菌液, 可以离心弃上清后,在同一个1.5ml管内加入更多的菌液,重复步骤1,直到收集到足够的菌体。
2、用250μl溶液A重悬菌体沉淀,涡旋振荡至彻底悬浮。
如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。
3、加250μl的溶液B,温和地上下翻转6 -8次使菌体充分裂解,室温放置4分钟。
温和地混合,不要剧烈震荡,以免基因组DNA剪切断裂!所用时间不应超过5分钟!以免质粒受到破坏。此时菌液应变得清亮粘稠,如果菌体少,很快清亮粘稠后就可以做下一步,不是一定要准确的5分钟。
4、加250μl溶液D,立即温和地上下翻转6 -8次,充分混匀时会出现白色絮状沉淀。13,000rpm离心10分钟,小心取上清至新管,避免吸取到漂浮白色沉淀。
加入溶液D后应该立即混匀,以免产生SDS的局部沉淀。
5、加入0.1体积(上清的体积的10%,约80µl)的内毒素清除剂ER到上一步所得上清,颠倒旋转混匀,冰浴或者插入碎冰中(或冰箱冷冻室)放置5分钟直到浑浊变清亮透明(或仍旧稍有浑浊),中间偶尔混匀几次。
内毒素清除剂ER加入上清后,上清会变得浑浊,但是冰浴后应恢复清亮(或稍浑浊)。
6、常温放置3-5分钟,温度恢复室温溶液很快变为浑浊,颠倒混匀。
如室内温度较低或者想加快速度可以在37-42℃水浴,将很快变浑浊,颠倒混匀。
7、室温14,000 x g离心10 分钟分相 。上层水相含DNA,下层蓝色油状相含内毒素和其它杂质。将含DNA的上层水相转移到新管(注意不要吸到蓝色油状层,里面含内毒素等杂质),弃油状层。
平衡液BS预处理吸附柱:
使用平衡液BS预处理硅胶膜吸附柱为必做步骤,具体方法参见前文“关于平衡液BS的使用”
8、向上层水相中加入0.5体积异丙醇(约370µl)后充分颠倒混匀后分两次(每次不超过700µl)转入吸附柱AD中(吸附柱AD放入收集管CT中),12,000 x g离心1分钟,倒掉收集管CT中的废液。直到所有混合溶液通过此吸附柱。
9、加入600μl漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。再加入600μl漂洗液WB,重复漂洗一次。
10、将吸附柱AD放回空收集管CT中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
11、取出吸附柱AD,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加50-100μl洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液事先在 65-70℃水浴中加热效果更好),室温放置2分钟,12,000rpm 离心1分钟。如果需要较多量质粒,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2分钟,离心1分钟。
洗脱体积越大,洗脱效率越高。如果需要质粒浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积不应少于30μl,体积过小降低质粒洗脱效率,减少质粒产量。