1/适用范围:
适用于快速提取复杂植物组织细胞总RNA,使用独有基因组DNA清除柱技术可有效清除电泳可见gDNA残留,RNA可用于反转录PCR,荧光定量PCR等。
2/试剂盒组成、储存、稳定性:
试剂盒组成
|
保存
|
50次(RE122-01)
|
裂解液CLB
|
室温
|
50 ml
|
裂解液LBT Plus
|
室温
|
25 ml
|
去蛋白液PRS
|
室温
|
40 ml
|
漂洗液RB
|
室温
|
10 ml
第一次使用前按说明加指定量乙醇
|
RNase-free H2O
|
室温
|
10 ml
|
基因组DNA清除柱CC
和收集管CT
|
室温
|
50套
|
RNase-free
吸附柱AC和收集管CT
|
室温
|
50套
|
本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。
3/储存事项:
1、不合适的储存于低温(4℃或者-20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室温下(15℃-25℃)进行。
2、避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
4/产品介绍:
本公司在独家推出GenePure无苯酚、氯仿RNA快速提取技术基础上,又独家研发成功基因组DNA清除柱技术可以有效清除gDNA残留,得到的RNA一般不需要DNase消化,可用于反转录PCR、荧光定量PCR等实验。独特的裂解液迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶, 离心沉淀去除多糖多酚和次级代谢产物,然后裂解混合物用乙醇调节RNA结合吸附到基因组DNA清除柱,然后RNA被选择性洗脱滤过,吸附在基因组DNA清除柱上的残留DNA无法洗脱连同柱子一起丢弃从而清除掉DNA。滤过的RNA用乙醇调节结合条件后,RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的RNase free H20将纯净RNA从硅基质膜上洗脱。
5/产品特点:
1、完全不使用有毒的苯酚,氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
2、简捷,单个样品操作一般可在25分钟内完成,世界上最简单快速的试剂盒。
3、独家研发成功基因组DNA清除柱技术可以有效清除gDNA残留,得到的RNA一般不需要DNase消化,可用于反转录PCR、荧光定量PCR等实验。
4、适应性极其广泛,可以提取包括复杂中草药、复杂淀粉种子、复杂果实、复杂抗逆植物、复杂花卉、复杂多糖植物等数百种国内外试剂盒提取失败的样品。
5、多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.9~2.2,基本无DNA残留,可用于RT-PCR,Northern-blot,二代测序和各种实验。
6/注意事项
1、所有的离心步骤均可在室温完成(4℃离心也可以),使用转速可以达到13,000 rpm的传统台式离心机。
2、需要自备β-巯基乙醇,乙醇,研钵(可选)。
3、样品处理量绝对不要超过基因组清除柱CC和和RNA吸附柱AC处理能力,否则造成DNA残留或产量降低。开始摸索实验条件时,如果不清楚样品DNA/RNA含量时可使用较少的样品处理量,将来根据样品试验情况增加或者减少处理量。
4、裂解液CLB和LBT Plus 和去蛋白液PRS中含有刺激性化合物,操作时戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
5、关于DNA 的微量残留:
一般说来任何总RNA提取试剂在提取过程中无法完全避免DNA的微量残留(DNase消化也无法做到100%无残留),本公司的GenePure Plus RNA提取产品,由于采取了本公司独特的缓冲体系和基因组DNA清除柱技术,绝大多数DNA已经被清除,不需要DNase消化,可直接用于反转录PCR和荧光定量PCR。个别特殊情况如DNA含量过于丰富造成残留或者要进行严格的mRNA表达量分析荧光定量PCR,我们建议在进行模板和引物的选择时:
- ① 选用跨内含子的引物,以穿过mRNA中的连接区,这样DNA就不能作为模板参与扩增反应。
- ② 选择基因组DNA和cDNA上扩增的产物大小不一样的引物对。
- ③ 将RNA提取物用RNase-free的DNase I 处理。本试剂盒还可以用于DNase I处理后的RNA清洁(cleanup) ,请联系我们索取具体操作说明书。
- ④ 步骤去蛋白液PRS漂洗前,直接在吸附柱AC上进行DNase I柱上消化处理。购买DNA酶柱上消化试剂盒(货号:RE128)前可先索取具体操作说明书。
7/操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)
提示:
● 第一次使用前请先在漂洗液RB瓶加入指定量无水乙醇!
● 取1ml裂解液 CLB至离心管内(如果CLB有析出或者沉淀需先置于65°C水浴重新溶解),在裂解液CLB中加入5% β-巯基乙醇(1ml CLB加50μl β-巯基乙醇)。颠倒混匀后65°C水浴中预热。多个样品按照比例放大准备。
1、直接研磨法(实验室无液氮情况下或者柔软易研磨植物样品推荐此法):
a. 新鲜植物组织或者冰冻保存样品称重后取100-200mg(水分少的样品如叶片种子等可加100-150mg,水分多的样品如草莓西瓜果实可多加一些)迅速剪成小块放入研钵,加入 1ml CLB(已加有β-巯基乙醇)室温下充分研磨成匀浆,注意应该迅速研磨让组织和裂解液CLB立刻充分接触以抑制RNA酶活性。
β-巯基乙醇是裂解液CLB的关键成分,必要的时候可以提高终浓度到10-20%。
如果特别复杂植物,可以尝试在裂解液中加入PVP40至终浓度2%。
b. 将裂解物转入离心管,立即剧烈振荡15秒,短时放回 65°C水浴中(5-10 min),中间偶尔颠倒1-2次帮助裂解。13,000rpm离心10分钟,沉淀不能裂解的碎片。
c. 取裂解物上清(在不超过基因组DNA清除柱CC能力的情况下可以取更多的上清,这样可以提高产量)转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇(0.5体积),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
若上清表面有漂浮物,用吸头挑开吸取下面液体即可。
d. 立刻接操作步骤的步骤3。
2、液氮研磨法(适用广泛,提取复杂难破碎,易降解样品时推荐此法):
a. 液氮中研磨新鲜或-70°C冷冻的材料至细粉。
b. 转移100-200mg细粉(水分少的样品如叶片种子等可加100-150mg,水分多的样品如草莓西瓜果实可多加一些)加至预热的裂解液CLB(已加有β-巯基乙醇)离心管中。立即剧烈涡旋30-60秒或者用吸头吹打混匀裂解直得到满意匀浆结果(或者电动匀浆30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高产量。
c. 短时放回 65°C水浴中(5-10 min),中间偶尔颠倒1-2次帮助裂解。
d. 将裂解物13,000 rpm离心10分钟,沉淀不能裂解的碎片。
e. 取裂解物上清(在不超过基因组DNA清除柱CC能力的情况下可以取更多的上清,这样可以提高产量)转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇(0.5体积),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
若上清表面有漂浮物,用吸头挑开吸取下面液体即可。
f. 立刻接操作步骤的步骤3。
3、将混合物(每次小于720μl,多可以分两次加入)加入一个基因组清除柱CC中,(清除柱CC放入收集管CT中)13,000 rpm离心2分钟,弃掉废液。
确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。
4、将基因组DNA清除柱CC放在一个干净2ml离心管内(不用RNAse free 或者DEPC处理,一般干净的新离心管即可。也可使用RNA吸附柱配套的新的干净收集管CT),在基因组清除柱CC内加500μl裂解液LBT Plus,13,000 rpm离心30秒, 收集滤液(RNA在滤液中),用微量移液器较精确估计滤过液体积(通常为450-500μl左右,滤过时候损失体积应该减去),加入0.5倍体积的无水乙醇,此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
5、立刻将混合物(每次小于720μl,多可以分两次加入)加入一个吸附柱AC中,(吸附柱AC放入收集管CT中)13,000 rpm离心2分钟,弃掉废液。
确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。
6、加700μl 去蛋白液PRS,室温放置1分钟,13,000rpm 离心30秒,弃掉废液。
7、加入500μl漂洗液RB(请先检查是否已加入无水乙醇!),13,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。加入500μl漂洗液RB,重复一遍。
8、将吸附柱AC放回空收集管CT中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
9、取出吸附柱AC,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50μl RNase free water(事先在 70-90℃水浴中加热可提高产量), 室温放置1分钟,12,000 rpm 离心1分钟。
10、如果预期RNA产量>30μg,加30-50μl RNase free water重复步骤9,合并两次洗液,或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍(如果需要RNA浓度高)。
洗脱两遍的RNA洗脱液浓度高,分两次洗脱合并洗脱液的RNA产量比前者高15–30%,但是浓度要低,用户根据需要选择。
8/附录:RNA含量少样品或者RNA复杂产量低的解决方案
可以提高样品处理量到300-500mg/2ml裂解液CLB,上清过两根基因组DNA清除柱CC,洗脱下来的RNA,可以两个合并到一根RNA吸附柱上,可以大大提高RNA浓度。