1/适用范围:
适用于快速提取植物组织、细胞、真菌基因组DNA。
2/试剂盒组成、储存、稳定性:
试剂盒组成
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保存
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10次(DE118-01)
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RNase A(10mg/ml)
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-20℃
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500 μl
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裂解液A
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室温
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50 ml
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裂解液B
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室温
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20 ml
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裂解液C
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室温
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40 ml
第一次使用前按说明加指定量乙醇
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漂洗液WB
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室温
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25ml x2
第一次使用前按说明加指定量乙醇
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洗脱缓冲液EB
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室温
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20 ml
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吸附柱DA
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室温
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10个
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收集管CT(50ml)
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室温
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10个
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本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。
3/储存事项:
① 裂解液A、C低温时可能出现析出和沉淀,可以在65℃水浴几分钟帮助重新溶解(裂解液C加入乙醇前可加热,加入乙醇后不可加热),恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。
② 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
4/产品介绍:
该试剂盒采用DNA吸附柱和新型独特的溶液系统,适合于从含酚类、多糖类和酶抑制物的植物样品中快速简单地提取基因组DNA。可在1小时左右完成一个或多个1g新鲜或200mg干燥的植物样品DNA的纯化工作。提取过程不需要用到有毒的酚氯仿等有机物抽提,也不需要用到耗时的异丙醇或乙醇沉淀,并能快速高效地去除多糖类、酚类和酶抑制物等杂质,纯化的DNA可直接用于PCR、酶切和杂交等实验。
新鲜或干燥的植物组织(细胞)磨碎后经裂解液裂解;蛋白质、多糖、细胞残片被沉淀去除;然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜, 再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 进一步将多糖,多酚和细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。
5/产品特点:
① 离心吸附柱内硅基质膜全部采用特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。
② 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
③ 快速,简捷,单个样品操作一般可在1小时内完成。
④ 数种去多糖、多酚成份和多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9,可直接用于PCR,Southern-blot和各种酶切反应。
6/注意事项
① 开始实验前将需要的水浴先预热到65℃备用。
② 裂解液C中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
③ 不同来源的植物组织材料中提取DNA 的量会有差异,一般1g新鲜组织典型产量可达30-260μg。
④ 洗脱液EB不含有螯合剂EDTA, 不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱, 但应该确保pH大于7.5, pH过低影响洗脱效率。用水洗脱DNA应该保存在-20℃。DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱 (10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。
7/操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)
提示:
- ● 第一次使用前请先在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
- ● 第一次使用前请先在裂解液C中加入指定量无水乙醇!
- ● 将裂解液A在65℃水浴预热。
- 1、取适量植物组织(最大处理量不超过新鲜组织1g 或干重组织200 mg)在研钵中加入液氮充分碾磨成细粉。
- 2、转移细粉到一个15ml离心管,不要解冻,加入5ml裂解液A(已经65℃预热) 和40μl RNase A(10 mg/ml),旋涡振荡,充分混匀帮助裂解。如果组织裂解困难,可根据需要加一个轻柔匀浆10秒的步骤帮助裂解。大多数情况下不需要离心去除未完全裂解的组织,因为后面有一个离心去除的步骤。
- 3、65℃水浴10-15分钟,在水浴过程中颠倒离心管2-3次,混合样品。
- 4、加入1.8ml裂解液B,充分混匀,冰上放置10分钟, 9,000 x g 室温离心10 分钟,小心吸取上清到一个新的50ml离心管,注意不要吸到界面物质。如果没有高速离心机,也可以4,000-5,000 x g离心,适当延长时间即可。
- 5、计算上清量,加入1.5倍体积的裂解液C(请先检查是否已加入无水乙醇!),立即涡旋振荡混匀。加入裂解液C可能会出现絮状沉淀,但不影响DNA提取。注意将裂解液C直接加入到上清并立即涡旋振荡混匀。
- 6、将上一步所得混合物(包括可能出现的沉淀)加入一个吸附柱DA中,(吸附柱放入收集管CT中)3,000-5,000 x g离心5分钟,倒掉收集管CT中的废液。
- 7、加入10ml漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),3,000-5,000 x g离心4分钟,弃掉废液。
- 8、加入10ml漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),3,000-5,000 x g离心3分钟,弃掉废液。
- 9、将吸附柱DA放回空收集管CT中,最高速(最好大于9,000 x g,如果离心机转速低,需要相应延长离心时间)离心10分钟以干燥膜基质残留乙醇,用枪头吸除内圈压环和柱壁之间可能残留的乙醇,室温或者烘箱晾干几分钟。
- 10、取出吸附柱DA,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加1-2ml洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液可事先在 65-70℃水浴中预热), 室温放置5分钟,3,000-5,000 x g离心3分钟,得到DNA。此外将得到的溶液重新加入吸附柱中,室温放置2分钟后再洗脱一遍,可以提高浓度和产量。洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果预计和需要产量高,可增大洗脱体积,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积不应少于500μl,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。
- 11、DNA可以存放在2-8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃。
8/问题与解决方法
问题
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评论与建议
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DNA产量低
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*处理材料过量或者裂解不完全
-建议:使用适量的起始材料,充分研磨或者匀浆
*结合条件不恰当
-建议:步骤5精确估计上清量,加入1.5倍体积裂解液C量要准确
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RNA残留
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*植物RNA含量太丰富
-建议:提高RNase A处理浓度
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未提取到DNA
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*漂洗液WB中忘记加无水乙醇
-建议:第一次实验时,在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇。
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离心柱堵塞
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*研磨裂解不充分,团块多;裂解物太粘稠;离心力太小
-建议:参见步骤2,加一个离心步骤去除;减低起始材料量,不要处理过量,加大离心力
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洗脱下来的
DNA溶液带颜色
或者膜上有明显
的色素残留
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*漂洗次数不够
-建议:步骤8完成后,加10ml乙醇再漂洗一遍
*起始材料太多过量
-建议:减少起始处理材料,不要过量
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洗脱下来的
DNA产量低
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*离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇
-建议:确保做了步骤9,否则残留乙醇会影响洗脱效率。
*使用了水或者其它非最佳液体代替洗脱缓冲液
-建议:仔细阅读步骤10和注意事项4和只使用洗脱缓冲液EB洗脱。
*洗脱缓冲液量偏低
-建议:使用2ml洗脱缓冲液洗脱
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A260吸光值
异常偏高
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*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了吸光值
-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。
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DNA下游酶切
不能切开或者
酶切不完全
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*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应
-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。
*离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇抑制了酶切反应
-建议:确保做了步骤9,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。
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