选择性凋亡DNA Ladder抽提试剂盒
DE123
25次、50次
适用于提取凋亡DNA Ladder
规格 价格
25次 ¥840
50次 ¥1558

1/适用范围:

适用于提取凋亡DNA Ladder。 

 

 

2/试剂盒组成、储存、稳定性:

试剂盒组成

保存

25次

(DE123-01)

50次

( DE123-02)

Extraction buffer

4 ºC

5 ml

10 ml

10% SDS

室温

500µl

1 ml

Enzyme A

-20 ºC

500µl

1 ml

Enzyme B

-20 ºC

500µl

1 ml

Precipitant

4 ºC

3.5 ml

7 ml

 

 


3/注意事项:

为保持活性方便运输,Enzyme B客户收到时为冻干粉,收到后加500µl灭菌水(25次)或者1ml灭菌水(50次)溶解后-20 ºC保存。Enzyme A和Enzyme B为酶溶液,应该避免反复冻融降低活性,如果要分多次使用,最好按照每次使用量分装后-20 ºC保存。

 

 

4/产品介绍:

凋亡(apoptosis)或程序性死亡的细胞一个形态学的显著特点是染色体DNA以核小体为单位(185 bp)规律断裂形成长度约为n×185bp (n=1,2,3,4…) 的DNA片段,经琼脂糖凝胶电泳显示为阶梯状凋亡DNA Ladder,是凋亡细胞最直观的特征。本试剂盒选择性从组织和细胞中分离提取凋亡DNA ladder,通过选择性分离基因组DNA与凋亡DNA ladder,最大限度的减少了基因组DNA对凋亡DNA ladder的观察干扰,因此显著的提高了检测敏感度,反应可在微量离心管进行,2.5小时完成,快速方便;无需有机抽提,检测灵敏度极高,可从约2000个凋亡细胞中检测到DNA ladder。推荐起始细胞量为5~10 × 105 个,但投入的细胞量可在1 × 105 ~ 5 × 106之间变化。原则是总细胞中应含有至少约1~2 × 104个凋亡细胞。多于2 × 104个凋亡细胞通常可获得十分清晰的凋亡DNA ladder。本试剂盒也可用于从组织中提取凋亡DNA ladder。但与培养细胞相比,整体动物组织凋亡细胞出现的时间、部位、程度等规律性差往往造成难以准确取材,可能显著影响实验结果。但只要组织确实发生凋亡,有经验的用户也可以使用本试剂盒从组织提取凋亡DNA ladder (参见说明4)。

 

 

5/产品说明:

① 溴化乙锭染色过度将降低DNA条带检测灵敏度,可用水冲洗凝胶10~30分钟。如冲洗过头可再用溴化乙锭复染。可用更灵敏的DNA染色剂SYBR Green。也可进行丙烯酰胺DNA凝胶电泳和DNA银染。

② 对细胞进行干预处理后,凋亡可能仅在某一时间点或某一干预强度下最为明显。需要进行预试验确定最佳干预时间或强度。此时也可用凋亡小体/hoeschst染色试剂盒(DN1801)快速染色凋亡小体观察。

③ 推荐起始细胞量为5~10 × 105 个,但投入的细胞量可在1 × 105 ~ 5 × 106之间变化。原则是总细胞中应含有至少约1~2 × 104个凋亡细胞。多于2 × 104个凋亡细胞通常可获得十分清晰的凋亡DNA ladder。六孔板的一个孔相当于一个35 mm培养皿长满后可得到1~10 ×105 个细胞,如果细胞凋亡发生率为10%,经过处理可得到约1~10 × 104个凋亡细胞,应该足以获得清晰的凋亡DNA ladder。反之如果不能从>3 ×106个细胞获得清晰的凋亡DNA ladder,表明其中凋亡细胞少于1%。此时增加细胞用量也难已奏效。

④ 从组织块提取凋亡DNA ladder。取10~20 mg组织块放入小玻璃匀浆器,加100~200μl Extraction buffer,上下手动匀浆15~20次。取出匀浆液,冰上5~10 min。振荡10秒。4500 rpm 10分钟收集上清液并转移到新1.5ml离心管,执行提取步骤3。另外一种方法是将30~50mg组织剪碎后在PBS里面匀浆,制成细胞悬液,离心收集细胞后接步骤2继续执行提取。

⑤ 采用高质量琼脂糖,使用宽度较小和厚度较窄的样品梳子,制作较薄的琼脂糖凝胶(厚度约2~4 mm);用较低的电压进行慢速电泳,将显著增加凋亡DNA条带检测灵敏度。电泳距离不要太长,否则将使小的凋亡DNA条带弥散而降低分辨率。

 

 

6/操作步骤:

1、用PBS漂洗细胞两遍后微型离心机500 ×g 4ºC 5 min收集5~10 × 105个细胞(最好同时做一个未凋亡细胞的对照)。小心用移液枪吸弃上清,除尽管壁附着液体。

2、将离心管底部的细胞沉淀用手指轻轻弹松打散后,加入100µl的Extraction buffer,用振荡器激烈混合10秒钟后,1,100~1,600 xg(约3500~4500 rpm)离心5分钟。

3、勿触动管底沉淀,将上清液转移到新的1.5ml离心管。

4、沉淀按操作2.方法再重复一次。

5、把上清液与操作3.的上清液合并于一起共约200µl,作为粗提取液(含有凋亡DNA片段,未凋亡染色体DNA已经通过沉淀去除)。

6、向粗提取液中加入10% SDS 溶液 20µl后,再加入Enzyme A 20µl,混匀,56℃温育1小时。

7、向上述混合液中加入Enzyme B 20µl,混匀,37℃温育1小时,或者直到变得透亮(可过夜)。

8、向上述混合液中加入Precipitant 130µl后,颠倒混匀,再加入1 ml的乙醇,混匀后- 20℃放置1小时以上(沉淀凋亡DNA片段)。

9、至少13000rpm 4ºC离心15min,弃上清,加1ml 70%乙醇漂洗一遍后离心,倒去乙醇,并且尽量吸除管壁附着液体。敞开管口,室温晾干沉淀。

10、用17µl双蒸水或TE Buffer充分溶解沉淀,加3µl 6 x DNA凝胶上样缓冲液震荡混匀。取全部20µl 上样或者适量上样进行1% agarose gels电泳。溴化乙锭染色,紫外观察照相(凋亡发生率较低时,添加过量TE Buffer溶解沉淀有可能会导致浓度太稀,无法检出DNA Ladder,因此可减少用量,反之,可增加)。