酵母基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型)
DE119-01
50次
适用于快速提取各种酵母基因组DNA
规格 价格
50次(带Lytic Enzyme,蛋白酶K) ¥820

1/适用范围:

适用于快速提取各种酵母基因组DNA。

 

 

2/试剂盒组成、储存、稳定性:

试剂盒组成

保存

50次DE119-01

缓冲液Y

室温

20 ml

结合液CB

室温

11 ml

抑制物去除液IR

室温

25 ml

漂洗液WB

室温

15 ml       
第一次使用前按说明加指定量乙醇

洗脱缓冲液EB

室温

15 ml

Lytic Enzyme

-20℃

2.5 ml

蛋白酶K粉20mg/ml

-20℃

20mg

吸附柱DA

室温

50个

收集管CT(2ml)

室温

50个

                                   本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。

 

 

3/储存事项:

① 结合液CB或者抑制物去除液IR低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。

② 为避免降低活性,方便运输,提供蛋白酶K为冻干粉状(20mg),收到后,可短暂离心后,加入1毫升灭菌水溶解配制成20mg/ml溶液,因为反复冻融可能会降低酶活性,因此溶解后立即按照每次使用量分装冻存,-20℃保存。

③ Lytic Enzyme为蜗牛酶甘油储液,因此比较粘稠,请小心取用,-20℃保存。 蜗牛酶是从蜗牛的嗦囊和消化道中制备的混合酶,它含有纤维素酶,果胶酶,淀粉酶,蛋白酶等20多种酶。适合破碎溶解各种酵母的细胞壁。

④ 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

 

 

4/产品介绍:

该试剂盒采用DNA吸附柱和独有的溶液系统,适合于从多种来源的酵母培养物中快速简单地提取基因组DNA。约3ml处于指数生长期的酵母培养液一般一次抽提可纯化出10-15μg的高质量的基因组DNA。纯化DNA产物可直接用于PCR、酶切和杂交等实验。酵母细胞经lytic Enzyme处理去除细胞壁后,独特的结合液/蛋白酶K迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸酶,然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜, 再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。

 

 

5/产品特点:

① 离心吸附柱内硅基质膜全部采用世界著名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。

② 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。

③ 快速,简捷,单个样品裂解后操作一般可在30分钟内完成。

④ 多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9,可直接用于PCR,Southern-blot和各种酶切反应。

 

 

6/注意事项:

① 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机。

② 需要自备乙醇、异丙醇、 β-巯基乙醇。

③ 开始实验前将需要的水浴先预热到37℃和70℃备用。

④ 结合液CB 和抑制物去除液IR中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

⑤ 用户需要自备Sorbitol buffer( 1M 山梨醇 0.1M Na2EDTA,14 mMβ-巯基乙醇)配制方法:在600 ml 去离子水里面溶解 182.2克山梨醇,加入200 ml 0.5 M Na2EDTA (pH 8.0) ,不需要调节PH值,定容到1L,4℃保存。临用前加0.2%β-巯基乙醇(商品化的β-巯基乙醇摩尔浓度一般为14M)

⑥ 菌体浓度检测一般OD260值为1的时候,酿酒酵母细胞是1-2x107 cells/ml,由于菌种和分光度计不同即使同样细胞数量OD值变化也很大,以上仅供参考。

⑦ 洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确保批pH大于7.5, pH过低影响洗脱效率。用水洗脱DNA应该保存在-20℃。DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。

 

 

7/操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)

提示:● 第一次使用前请先在15ml漂洗液WB中加入60ml无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!

  1.  ● 吸取使用量的Sorbitol buffer加入0.2%β-巯基乙醇,回复到室温备用。
  2.  
  3. 1、取1-3毫升酵母培养物(不超过3X107 cells,最好是早对数生长期),12,000rpm离心30秒,尽可能的吸弃上清,收集菌体。收集超过1.5毫升菌液,可以离心弃上清后,在同一个1.5ml管内加入更多的菌液,重复步骤1,直到收集到足够的菌体。
  4. 2、加入300μl Sorbitol buffer,轻柔吹打充分重悬细胞;再加入50μl Lytic Enzyme储液,充分颠倒混匀,37℃温育1-3小时消化细胞壁,中间可颠倒数次帮助消化。如果破壁效果不好导致产量低,可以加大Lytic Enzyme 用量来提高酶工作浓度,还可以延长消化时间或者提高温度到45来提高效果,不适合Lytic Enzyme消化的酵母可选用其它方法如0.5mm玻璃珠涡旋击打 ,反复冻融等。玻璃珠法:向菌体中加入180μl 缓冲液Y彻底悬浮菌体,加入0.1g直径为0.45-0.55mm的酸洗玻璃珠,涡旋振荡10分钟,静置几分钟让玻璃珠沉淀,小心吸取上清到一个新管后接后续步骤4
  5. 3、13,000rpm离心1分钟,尽可能吸弃上清,加180μl 缓冲液Y充分重悬细胞团。
  6. 4、加入20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),立刻涡旋振荡充分混匀。
  7. 5、将混合物放置在55℃水浴消化直到消化完全,期间轻柔的振荡几次帮助裂解。所需消化时间和酵母数量、种类和生长状态有关,一般15分钟即可,但是如果方便的话消化过夜也无不良影响。可选步骤,一般不需要: 如果RNA残留较多,需要去除RNA,可在完成操作步骤5后加20μl RNase A(25mg/ml)溶液,振荡混匀,室温放置5-10分钟。
  8. 6、加入200μl结合液CB,立刻涡旋振荡充分混匀,70℃放置10分钟。
  9. 7、冷却后加入100μl 异丙醇,立刻涡旋振荡充分混匀,此时可能会出现絮状沉淀。
  10. 8、将上一步混合物(包括可能有的沉淀)加入一个吸附柱DA中,(吸附柱DA放入收集管CT中)13,000rpm离心30-60秒,倒掉收集管CT中的废液。
  11. 9、加入500μl抑制物去除液IR,12,000rpm 离心30秒,弃废液。
  12. 10、加入600μl漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。
  13. 11、加入600μl漂洗液WB,12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。
  14. 12、将吸附柱DA放回空收集管CT中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
  15. 13、取出吸附柱DA,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100μl洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液事先在 65-70℃水浴中预热效果更好), 室温放置3-5分钟,12,000rpm 离心1分钟。将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2分钟,12,000rpm离心1分钟。洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积不应少于50μl,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。
  16. 14、DNA可以存放在2-8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃。

 

 

8/问题与解决方法:

问题

评论与建议

DNA产量低

*某些种类酵母裂解困难

-建议:仔细阅读步骤2,确认处理的酵母种类可以用Lytic Enzyme裂解,还可以考虑选用其它裂解方法如玻璃珠涡旋击打、煮沸、反复冻融等,使用早对数生长期酵母。

*蛋白酶K失效了

-建议:按照每次使用量分装冻存,避免反复冻融,延长处理时间。

*裂解不完全或者和异丙醇没有充分混匀

-建议:加入结合液后,和加入蛋白酶K后立即吹打或者涡旋混匀;加入异丙醇后立即吹打或者涡旋混匀才加入吸附柱,如果太粘稠必须涡旋振荡15秒充分混匀。

DNA降解

*组织中核酸酶活性导致降解

-建议样品处理前妥善保存在-20℃,处理量不要过量。

未提取到DNA

*漂洗液WB中忘记加无水乙醇

-建议:第一次实验时,在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇。

洗脱下来的
DNA产量低

*离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇

-建议:确保做了步骤12,否则残留乙醇会影响洗脱效率。

*使用了水或者其它非最佳液体代替洗脱缓冲液

-建议:仔细阅读注意事项7和步骤13和只使用洗脱缓冲液EB洗脱。

A260吸光值
异常偏高

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了吸光值

-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。

DNA下游酶切
不能切开或者
酶切不完全

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应

-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。

*离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇抑制了酶切反应

-建议:确保做了步骤12,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。