真菌基因组DNA快速提取试剂盒
DE128
50次、100次、200次
适用于快速提取真菌组织细胞基因组DNA
规格 价格
50次 ¥720
100次 ¥1260
200次 ¥2200

1/适用范围:

适用于快速提取真菌组织细胞基因组DNA。

 

 

2/试剂盒组成、储存、稳定性:

试剂盒组成

保存

50次

DE128-01

100次

DE128-02

RNase A(10mg/ml)

-20℃

250 μl

500 μl

缓冲液A

室温

25 ml

50 ml

缓冲液B

室温

10 ml

20 ml

缓冲液C

室温

15 ml

25 ml

第一次使用前按说明加指定量乙醇

漂洗液WB

室温

15 ml

25ml

第一次使用前按说明加指定量乙醇

洗脱缓冲液EB

室温

15 ml

20 ml

吸附柱DA

室温

50个

100个

收集管CT(2ml)

室温

50个

100个

                                  本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。

 

 

3/储存事项:

① 缓冲液A、C低温时可能出现析出和沉淀,可以在65℃水浴几分钟帮助重新溶解(缓冲液C加入乙醇前可加热,加入乙醇后不可加热),恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。

② 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

 

 

4/产品介绍:

该试剂盒采用DNA吸附柱和新型独特的溶液系统,适合于从真菌组织细胞中快速简单地提取基因组DNA。可在30分钟内完成一个或多个100mg新鲜或20mg干燥的真菌样品DNA的纯化工作。提取过程不需要用到有毒的酚氯仿等有机物抽提,也不需要用到耗时的异丙醇或乙醇沉淀,并能快速高效地去除多糖类、酚类和酶抑制物等杂质,纯化的DNA可直接用于PCR、酶切和杂交等实验。

新鲜或干燥的真菌组织(细胞)磨碎后经裂解液裂解;蛋白质、多糖、细胞残片被沉淀去除;然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜, 再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 进一步将多糖,多酚和细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。

 

 

5/产品特点:

① 离心吸附柱内硅基质膜全部采用特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。

② 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。

③ 快速,简捷,单个样品操作一般可在1小时内完成。

④ 数种去多糖、多酚成份和多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9,可直接用于PCR,Southern-blot和各种酶切反应。

 

 

6/注意事项:

① 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000 rpm的传统台式离心机。

② 开始实验前将需要的水浴先预热到65℃备用。

③ 缓冲液C中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

④ 不同来源的真菌组织细胞材料中提取DNA 的量会有差异,一般100mg新鲜组织典型产量可达3-25μg。

⑤ 洗脱液EB不含有螯合剂EDTA, 不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱, 但应该确保pH大于7.5, pH过低影响洗脱效率。用水洗脱DNA应该保存在-20℃。DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱 (10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。

 

 

7/操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)

提示:● 第一次使用前请先在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!

           ● 第一次使用前请先在缓冲液C中加入指定量无水乙醇!

1、取适量真菌组织在研钵中加入液氮充分碾磨成细粉。

2、转移细粉(新鲜真菌组织100 mg 或干重组织20 mg)到一个1.5ml离心管,不要解冻,加入400μl缓冲液A 和4μl RNase A(10 mg/ml),旋涡振荡,充分混匀帮助裂解。

如果组织裂解困难,可根据需要加一个轻柔匀浆10秒的步骤帮助裂解。大多数情况下不需要离心去除未完全裂解的组织,因为后面有一个离心去除的步骤。

可选:多糖含量特别高的时候可以在缓冲液A加入2%PVP40,000; 多酚含量特别高的时候可以在缓冲液A中加入0.2% beta巯基乙醇。也可两者同时加入。

3、65℃水浴10分钟,在水浴过程中颠倒离心管2-3次,混合样品。

4、加入130 μl 缓冲液B,充分混匀,冰上放置5分钟, 14,000 rpm 离心5-10 分钟,小心吸取上清到一个新的1.5ml离心管,注意不要吸到界面物质。

5、计算上清量,加入1.5倍体积的缓冲液C(请先检查是否已加入无水乙醇!),立即吹打混匀。

加入缓冲液C可能会出现絮状沉淀,但不影响DNA提取。注意将缓冲液C直接加入到上清并立即吹打混匀。

6、将上一步所得混合物(包括可能出现的沉淀)加入一个吸附柱DA中,(吸附柱DA放入收集管CT中)13,000 rpm离心30-60秒,倒掉收集管CT中的废液(先加650μl离心,弃废液,再加入剩余的溶液,再次离心)。

7、加入600μl漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。

8、加入600μl漂洗液WB,12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。

9、将吸附柱DA放回空收集管CT中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

10、取出吸附柱DA,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100μl洗脱缓冲液EB, 室温放置3-5分钟,12,000 rpm 离心1分钟。将得到的溶液重新加入吸附柱中,室温放置2分钟,12,000 rpm离心1分钟。

洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果预计和需要产量高,可增大洗脱体积,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积不应少于50μl,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。

11、DNA可以存放在2-8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃。

 

 

8/问题与解决方法

问题

评论与建议

DNA产量低

*处理材料过量或者裂解不完全

-建议:使用适量的起始材料,充分研磨或者匀浆

*结合条件不恰当

-建议:步骤5精确估计上清量,加入1.5倍体积缓冲液C量要准确

RNA残留

*真菌RNA含量太丰富

-建议:提高RNase A处理浓度

未提取到DNA

*漂洗液WB中忘记加无水乙醇

-建议:第一次实验时,在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇。

离心柱堵塞

*研磨裂解不充分,团块多;裂解物太粘稠;离心力太小

-建议:参见步骤2,加一个离心步骤去除;减低起始材料量,不要处理过量,加大离心力

洗脱下来的
DNA溶液带颜色
或者膜上有明显
的色素残留

*漂洗次数不够

-建议:步骤8完成后,加500μl乙醇再漂洗一遍

*起始材料太多过量

-建议:减少起始处理材料,不要过量

洗脱下来的
DNA产量低

*离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇

-建议:确保做了步骤9,否则残留乙醇会影响洗脱效率。

*使用了水或者其它非最佳液体代替洗脱缓冲液

-建议:仔细阅读步骤10和注意事项5和只使用洗脱缓冲液EB洗脱。

*洗脱缓冲液量偏低

-建议:使用200μl洗脱缓冲液洗脱

A260吸光值
异常偏高

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了吸光值

-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。

DNA下游酶切
不能切开或者
酶切不完全

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应

-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。

*离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇抑制了酶切反应

-建议:确保做了步骤9,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。