固定包埋组织DNA快速提取试剂盒
DE134
50次、100次
适用于快速提取各种福尔马林固定和石蜡包埋组织DNA
规格 价格
50次(带蛋白酶K) ¥720
100次(带蛋白酶K) ¥1268

一、适用范围:

适用于快速提取各种福尔马林固定和石蜡包埋组织DNA。

 

 

二、试剂盒组成、储存、稳定性:

试剂盒组成

保存

50次

DE134-01

100次

DE134-02

裂解液FTL

室温

11 ml

20 ml

结合液CB

室温

11 ml

20 ml

抑制物去除液IR

室温

25 ml

50 ml

漂洗液WB

室温

15 ml

25 ml

第一次使用前按说明加指定量乙醇

洗脱缓冲液EB

室温

15 ml

15 ml

蛋白酶K粉

30mg/ml

-20℃

30mg

60mg

吸附柱DA

室温

50个

100个

收集管CT(2ml)

室温

50个

100个

                                    本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。

 

 

三、储存事项:

结合液CB或者抑制物去除液IR低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。

为避免降低活性、方便运输,提供蛋白酶K为冻干粉状,收到后,可短暂离心后,10mg/20mg加入0.5ml/1ml灭菌水溶解,因为反复冻融可能会降低酶活性,因此溶解后立即按照每次使用量分装冻存,-20℃保存。

避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

 

 

四、产品介绍:

福尔马林固定或者石蜡包埋组织通过独特裂解液热处理和蛋白酶K共同作用迅速裂解细胞释放出基因组DNA,然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜, 再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物、蛋白等杂质去除, 最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。

 

五、产品特点:

① 离心吸附柱内硅基质膜全部采用世界著名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。

② 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。

③ 快速,简捷,单个样品操作一般可在30分钟内完成。

④ 多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9,长度可达30kb -50kb,可直接用于PCR,Southern-blot和各种酶切反应。

 

 

六、注意事项:

① 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机。

② 需要自备乙醇(需要准备100%/80%/60%/40%不同浓度)或者二甲苯。

③ 实验前将需要的水浴先预热到37℃备用。

④ 结合液CB和抑制物去除液IR中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

⑤ 洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确保批pH大于7.5, pH过低影响洗脱效率。用水洗脱DNA应该保存在-20℃。DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。

 

 

七、操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)

提示:第一次使用前请先在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!

1、将组织切片放入离心管子,浸泡在二甲苯中脱蜡约30分钟(具体时间根据切片厚度调整)。

2、将切片依次放入100%乙醇/80%乙醇/60%乙醇/40%乙醇/去离子水,每个液体中浸泡10秒钟重新水化切片。刚放入100%乙醇时,应该见到切片变白。

3、显微镜观察下,用刀片切下拟提取DNA的目标组织,放入预先称重的1.5ml离心管。再次称重,计算出切片组织重量。

4、在25-50mg组织中加入200μl裂解液FTL,再加入20μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),立即混匀混匀后置37℃水浴过夜。

5、再加入10μl的蛋白酶K溶液(20mg/ml),混匀后55℃水浴1-2小时。此步骤后,不应该出现粗大的组织颗粒。

6、加入200μl 结合液CB,立刻涡旋振荡20秒充分混匀后置70℃水浴10分钟。

7、冷却后加入100μl 异丙醇,立刻涡旋振荡30秒充分混匀,此时可能会出现絮状沉淀。

8、用1毫升的枪头吸取混合物,将混合物加入一个吸附柱DA中,(吸附柱放入收集管CT中)13,000rpm离心60秒,倒掉收集管CT中的废液。如果有不溶组织物可能堵住枪头,可将枪头在吸水纸上轻蹭去除不溶物;如果吸上来的混合物少则可以将枪头和不溶物一起弃去,该做法是为了去除不溶物,以免堵塞离心柱

9、加入500μl抑制物去除液IR,12,000rpm 离心30秒,弃废液。

10、加入600μl漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。

11、加入600μl漂洗液WB,12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。

12、将吸附柱DA放回空收集管CT中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

13、取出吸附柱DA,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100μl洗脱缓冲液EB (洗脱缓冲液事先在65-70℃水浴中预热效果更好), 室温放置3-5分钟,12,000rpm 离心1分钟。将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2分钟,12,000rpm离心1分钟。

洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积不应少于50μl,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。

14、DNA可以存放在2-8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃。

 

 

八、附录:另外一种脱蜡方式

1、将目标组织切片放入离心管,加入1ml 100%二甲苯,涡旋振荡10秒。瞬间离心把组织全部浸入到二甲苯。

2、50℃水浴3分钟熔解石蜡,20-25℃最高速离心2分钟,收集组织到管底。

3、小心用移液器吸弃上清二甲苯,注意不要吸到沉淀。

4、加入1ml无水乙醇,涡旋振荡,最高速离心2分钟,小心吸弃上清乙醇。

5、加入1ml无水乙醇,重复步骤4,尽可能吸弃所有乙醇。

6、室温或者37℃ 晾干乙醇10分钟或直到所有乙醇挥发干。

 

 

九、问题与解决方法:

问题

评论与建议

DNA产量低

*组织块太大,蛋白酶K消化不完全

-建议:液氮研磨或者尽量将组织切成小块,或者延长蛋白酶K消化时间至过夜或者在原有消化基础上另加20μl蛋白酶K消化1-2小时。

*蛋白酶K失效了

-建议:收到蛋白酶K后,按照每次使用量分装冻存,避免反复冻融。

*裂解不完全或者和异丙醇没有充分混匀

-建议:加入结合液后,和加入蛋白酶K后立即吹打或者涡旋混匀;加入异丙醇后立即吹打或者涡旋混匀才加入吸附柱,如果太粘稠必须涡旋振荡15秒充分混匀。

组织DNA
降解了

*组织中核酸酶活性导致降解

-建议:样品处理前妥善保存在-20℃,处理量不要过量。

未提取到DNA

*漂洗液WB中忘记加无水乙醇

-建议:第一次实验时,在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇。

洗脱下来的
DNA产量低

*离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇

-建议:确保做了步骤12,否则残留乙醇会影响洗脱效率。

*使用了水或者其它非最佳液体代替洗脱缓冲液

-建议:仔细阅读仔细阅读注意事项5和步骤13和只使用洗脱缓冲液EB洗脱。

A260吸光值
异常偏高

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了吸光值

-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。

DNA下游酶切
不能切开或者
酶切不完全

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应

-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。

*离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇抑制了酶切反应

-建议:确保做了步骤7,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。