λ噬菌体基因组DNA快速提取试剂盒
DE126
50次、100次
适用于快速λ噬菌体DNA
规格 价格
50次 ¥2100
100次 ¥3580

1/适用范围:

适用于快速λ噬菌体DNA。 

 

 

2/试剂盒组成、储存、稳定性:

试剂盒组成

保存

50次

DE126-01

100次

DE126-02

RNase A

-20℃

20 mg

20 mg X 2

DNase I

-20℃

50 mg

50 mg X 2

噬菌体沉淀液PB

室温

100 ml

100ml X 2

裂解缓冲液LS

室温

30 ml

60 ml

杂质沉淀液IP

室温

5 ml

10 ml

结合液LB

室温

20 ml

40 ml

漂洗液WB

室温

15 ml               

 25 ml

第一次使用前按说明加指定量乙醇

洗脱缓冲液EB

室温

10 ml

15 ml

吸附柱DA

室温

50个

100个

收集管CT(2ml)

室温

50个

100个

                                                本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。

 

 

3/储存事项:

① 在RNase A管和DNase I管分别加入1毫升的裂解缓冲液LS吹打,颠倒混匀,充分溶解RNase A和DNase I后, 按照每次使用量分装-20℃冻存,有效期6个月。

② 结合液LB低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。

③ 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

 

 

4/产品介绍:

λ噬菌体载体广泛用于文库筛选,目的克隆培养获得大量的噬菌体颗粒需要提取λ噬菌体DNA来开展测序等后续工作。λ噬菌体裂解培养物离心后的上清,首先用RNase A /DNase I混合酶消化去除残留的宿主菌DNA/RNA,沉淀收集噬菌体,噬菌体被SDS裂解,残留碎片通过沉淀离心去除掉。裂解物上清中的λ噬菌体DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,将盐、细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将λ噬菌体DNA从硅基质膜上洗脱。

 

 

5/产品特点:

① 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。

② 节省时间,简捷,可用于液体培养裂解物和固体培养板的提取,单个样品操作一般可在1.5小时内完成。

③ 产量高,典型的产量10ml λ噬菌体裂解培养物上清可以提取约10µg λ噬菌体DNA。

④ 多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9。可以直接用来酶切和测序。

 

 

6/注意事项

① 使用转速可以达到13,000rpm的冷冻离心机。

② 开始实验前将需要的水浴先预热到37℃备用。

③ 需要自备氯仿,20%SDS。

④ 结合液LB含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

 

 

7/操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)

以10 ml噬菌体感染细菌培养上清提取举例

提示:

● 第一次使用前请先在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!

● 将噬菌体沉淀液PB放在冰上预冷。

 

1、将0.5%氯仿处理后的λ噬菌体感染的液体培养物10,000g(约12,000rpm) 4℃离心10分钟去除细胞碎片和残渣。 转速不能过高,时间不能过长,否则噬菌体可能和碎片一起沉淀,降低产量。

2、取10ml上清,加入20μl RNase和20μl DNase充分混匀37℃温育30分钟。每个噬菌体培养上清因生长和裂解情况不同而残留RNA/DNA量不等。RNase/DNase消化过头,可能减少产量;消化不完全,可能未消化的DNA/RNA和细胞碎片粘去部分噬菌体减低产量并/或者导致最后污染宿主菌DNA,因此应该根据实际情况适当调节用量和消化时间。

3、加入2 ml 冰预冷的噬菌体沉淀液PB,轻柔充分混匀后置冰上冷却(培养板裂解物必须在冰上放置30分钟)。

4、10,000g(12,000rpm)4℃离心10分钟,弃上清,干燥1分钟。沉淀下来的噬菌体外观为透亮或者稍白的沉淀。

5、加入500μl裂解缓冲液LS,吹打重悬噬菌体,加入100μl 20%SDS,立即轻柔颠倒混匀4-6次后,70℃温育10分钟,然后置冰上冷却。

6、加入100μl杂质沉淀液IP,立即轻柔颠倒混匀4-6次,最高速13,000g 4℃离心10分钟。

7、仔细将上清转入新的离心管,加入350μl结合液LB,轻柔涡旋混匀。

8、将上述混合物加入一个吸附柱DA中,(吸附柱放入收集管CT中)12,000rpm离心30秒,倒掉收集管CT中的废液。吸附柱一次最多只可以容纳大约700μl混合物,因此需要分次把混合物到吸附柱内,重复步骤8。

9、加入600μl漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃废液。

10、可选步骤:重复步骤9一遍。

11、将吸附柱DA放回空收集管CT中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

12、取出吸附柱DA,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100μl洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液事先在 50℃水浴中预热), 室温放置1分钟,12,000rpm 离心1分钟。如果想得到较多量的DNA,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,12,000rpm离心1分钟。

洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积不应少于40μl,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。

13、DNA可以存放在2-8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃。

 

 

8/问题与解决方法:

问题

评论与建议

低核酸产量
或者纯度不高

* 试剂盒储存在非最佳条件

-建议:收到试剂盒后总是存放在室温(15℃-20℃)。

* 缓冲液或者试剂暴露于减少它们有效性的条件下

-建议:储存在室温(15℃-20℃),每次用完后立刻盖紧盖子,以免溶液蒸发,pH改变和污染。

* 漂洗液WB中忘记加无水乙醇

-建议:第一次实验时,在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇。

* 试剂和样品没有充分混匀

-建议:加入每个试剂后都要充分混匀

* 噬菌体上清滴度太低

-建议:1.确认λ噬菌体已经完全裂解了宿主菌(加入0.5%的氯仿可以帮助完全裂解);2.离心去除宿主菌碎片残渣时间不能超过10分钟,转速不超过10,000g,否则否则噬菌体也可能和碎片一起沉淀丢失;3.重新培养一次噬菌体感染细菌。

* DNase I/RNase消化不足或者过头

-建议:消化过头,可能减少产量并导致最后污染宿主菌DNA;消化不完全,可能未消化的DNA,RNA和细胞碎片粘去部分噬菌体,因此可以适当调节用量。

宿主菌基因组
DNA残留过高

* DNase I/RNase失活或者反应条件不佳

-建议:DNase I/RNase必须溶解在裂解缓冲液LS中,必须分装冻存。λ噬菌体必须用LM(含镁离子)培养,在其它培养肉汤中,DNase消化活性可能受到影响。

加入噬菌体
沉淀剂后未见到
λ噬菌体沉淀

* 不适合的离心温度和离心力。

-建议:10,000g(12,000rpm)4℃离心10分钟。

* 上清中含λ噬菌体太少

-建议:离心前,样品置冰上冷却。参见前面滴度太低解决办法

DNA下游酶切不能切开或者酶切不完全

*忘记做步骤11,乙醇抑制了酶切反应

-建议:做步骤10,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应

-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。

*使用了错误的培养基培养λ噬菌体

-建议:λ噬菌体必须用LM(含镁离子)培养,在其它培养肉汤中,DNA酶切活性可能受到影响。培养板培养必须用琼脂糖Agarose板,如果用琼脂Agar板,可能抑制酶切。

纯化的DNA
产物D260
数值异常偏高

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了分光光度计读数

-建议:将洗脱的回收DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。