M13噬菌体单链基因组DNA快速提取试剂盒
DE125
50次、100次
适用于快速提取M13噬粒单链DNA
规格 价格
50次 ¥630
100次 ¥1120
200次 ¥1680

1/适用范围:

适用于快速提取M13噬粒单链DNA。

 

 

2/试剂盒组成、储存、稳定性:

试剂盒组成

保存

50次

DE125-01

100次

DE125-02

结合液MS

室温

25 ml

50 ml

漂洗液WB

室温

15 ml                25ml

第一次使用前按说明加指定量乙醇

洗脱缓冲液EB

室温

10 ml

20 ml

吸附柱DA

室温

50个

100个

收集管CT(2ml)

室温

50个

100个

                                   本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。

 

 

3/储存事项:

① 结合液MS低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。

② 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

 

 

4/产品介绍:

M13和其它的丝状噬菌体载体,在文库构建和为序列测序提供单链DNA和引人突变方面十分有用。将适量M13丝状噬菌体或者相关噬粒(M13来源)感染的液体培养物离心,上清中的单链噬菌体DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,将盐、细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净噬菌体单链DNA从硅基质膜上洗脱。

 

 

5/产品特点:

① 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。

② 节省时间,简捷,单个样品操作一般可在10分钟内完成。

③ 产量高,典型的产量800µl M13丝状噬菌体上清可以提取3µg噬菌体单链DNA。

④ 多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9。可以直接用来测序,一般典型可辨认读长达650bp。

 

 

6/注意事项

① 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机。

② 开始实验前将需要的水浴先预热到50℃备用。

③ 结合液MS含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

 

 

7/操作步骤:实验前请先阅读注意事项)

以800μl噬菌体感染细菌培养上清提取举例:

提示:第一次使用前请先在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!

1、将M13丝状噬菌体或者相关噬粒(M13来源)感染的液体培养物分装在1.5毫升离心管,12,000rpm离心5分钟沉淀菌体。

2、小心取800μl上清转入新的1.5ml离心管,加入400μl结合液MS,充分混匀。

如果使用的上清大于或者小于800μl,则结合液MS的用量需要按照比例增加或者减少。

3、将上述混合物加入一个吸附柱DA中,(吸附柱放入收集管CT中)13,000rpm离心15秒,倒掉收集管CT中的废液。

吸附柱一次最多只可以容纳大约700μl混合物,因此需要分次把混合物加到吸附柱内,重复步骤3。

4、加入600μl漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃废液。

5、将吸附柱DA放回空收集管CT中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

6、取出吸附柱DA,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加60μl洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液事先在 50℃水浴中预热), 室温放置1分钟,12,000rpm 离心1分钟。如果想得到较多量的DNA,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,10,000rpm离心1分钟。

洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是最小体积不应少于40μl,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。

7、DNA可以存放在2-8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃。

 

 

8/附录(M13噬菌体感染细菌培养上清准备过程):

下面举例说明M13噬菌体感染细菌培养上清准备过程,详细的M13噬菌体(或M13来源噬粒)培养和上清准备过程请参见『分子克隆』第二版。

1、37℃ 振摇过夜培养合适的噬菌体宿主菌(如JM109)。

2、使用6%的过夜培养菌接种新鲜的LB培养液,37℃振摇培养一个小时。

3、根据M13噬菌体的储存液的浓度(滴度)按照0.5-1.5%(V/V)的比例加入噬菌体来感染宿主菌。37℃振摇培养5-6个小时。

4、将上面M13丝状噬菌体或者相关噬粒(M13来源)感染的液体培养物分装在1.5ml离心管,12,000rpm离心5分钟沉淀菌体。

5、可选步骤: 小心取1ml上清转入新的1.5ml离心管, 重复步骤4离心5分钟。这步有助于去除上清中残留的微量宿主菌RNA或者DNA

6、小心取800μl上清转入新的1.5ml离心管。

7、现在可以按照操作步骤提取噬菌体单链DNA。、

 

 

9/问题与解决方法:

问题

评论与建议

低核酸产量
或者纯度不高

*试剂盒储存在非最佳条件

-建议:收到试剂盒后总是存放在室温(15℃-20℃)

*缓冲液或者试剂暴露于减少它们有效性的条件下

-建议:储存在室温(15℃-20℃),每次用完后立刻盖紧盖子,以免溶液蒸发,pH改变和污染。

*漂洗液WB中忘记加无水乙醇

-建议:第一次实验时,在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇。

*试剂和样品没有充分混匀

-建议:加入每个试剂后都要充分混匀

*噬菌体上清滴度太低

-建议:离心取噬菌体感染细菌培养物上清时离心最好不要超过5分钟,转速不要超过12,000rpm,否则噬菌体上清也可能离心下来。重新培养一次噬菌体感染细菌

*洗脱效率不高

-建议:确保做了步骤5,否则残留乙醇会影响洗脱效率,仔细阅读步骤6和只使用洗脱缓冲液EB洗脱

DNA下游酶切
不能切开或者
酶切不完全

*忘记做步骤5,乙醇抑制了酶切反应

-建议:做步骤5,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应

-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用

纯化的DNA
产物D260
数值异常偏高

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了分光光度计读数

-建议:将洗脱的回收DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。